אגודת הסטודנטים.ות מורכבת ממועצה, נציגי ונציגות השנתונים ויושבי ויושבות הראש של בתי הספר. יו”ר האגודה הינו גם יו”ר המועצה ולו המסכויות הקבועות בתקנון האגודה.
יושבי ויושבות ראש בתי הספר נבחרים על ידי המועצה כועד מנהל של האגודה ויש יו”ר ועד מנהל.
הנהלת האגודה מורכבת מיו”ר האגודה, סיו”ר האגודה ומנכ”ל האגודה לפי תקנון האגודה ולהם סמכויות הקבועות בתקנון האגודה.
בפועל בהתנהלות היום יומית ראש חטיבת אקדמיה וראש חטיבת הדוברות לוקחים חלק כהנהלת האגודה בשל חשיבותם באגודה.
יושב.ת ראש האגודה אמון על מדיניות הארגון וניהול כלל בעלי התפקידים על מנת לממש את הפוטנציאל המירבי בפועל לטובת הסטודנט.ית.